當嬰兒肛周膿腫反復流膿時，可以選擇非手術和手術兩種方式進行治療。

1.非手術治療

可以使用對革蘭陰性桿菌有效的抗生素，如青霉素、頭孢呋辛和紅霉素軟膏等。通過內服和外用相結合的方式進行抗感染治療。平時可以用溫水進行坐浴有利于緩解局部疼痛和炎癥。

2.手術治療

對于反復流膿的肛周膿腫，可能需要進行手術治療。手術方式包括膿腫切開引流術，對于位置較深的膿腫，需要置入引流管進行引流。手術治療應由專業(yè)醫(yī)生根據(jù)具體情況進行評估和決策。