在多數(shù)情況下，益生菌對腸道的刺激較小，被視為一種相對安全且有效的藥物。其主要功能是調(diào)節(jié)腸道菌群平衡，常用于治療因菌群紊亂引發(fā)的腹瀉。目前，市場上存在多種益生菌，例如乳酸菌、雙歧桿菌和枯草芽孢桿菌等。

慢性胃炎或胃潰瘍患者，建議在飯后服用益生菌，因?yàn)榭崭狗每赡軙碳の葛つ?，加重胃黏膜損傷。對于腸道功能嚴(yán)重失調(diào)的患者，益生菌在與致病菌相互作用的過程中，可能會導(dǎo)致腸道功能紊亂進(jìn)一步惡化。此外，免疫力低下以及重癥患者使用益生菌可能會導(dǎo)致腸道感染，進(jìn)而引發(fā)膿毒血癥或菌血癥等嚴(yán)重疾病。對益生菌過敏的人群應(yīng)禁止使用，兒童在使用益生菌時，應(yīng)咨詢醫(yī)師的建議，并在成人的監(jiān)護(hù)下使用。

同時，益生菌與抗酸藥或抗菌藥同時服用時可能會減弱彼此的效果，因此建議間隔三小時分開服用。