急性扁桃體炎一般是由病原體感染引起的，包括乙型溶血性鏈球菌、非溶血性鏈球菌、葡萄球菌、腺病毒、鼻病毒、單純性皰疹病毒等。

正常人咽部或扁桃體隱窩內(nèi)可能存在某些病原體，在身體防御能力正常時不會致病，但由于氣溫降低、季節(jié)交替、過度勞累、煙酒過度等因素導致機體或局部抵抗力下降，病原體可大量繁殖并侵入扁桃體，比如乙型溶血性鏈球菌、非溶血性鏈球菌、葡萄球菌、腺病毒、鼻病毒、單純性皰疹病毒等，從而引起急性扁桃體炎。同時，這類病原體具有傳染性，可通過飛沫或直接接觸而傳染。