陰莖短小如果是由于睪酮激素水平降低引起的，可以服用激素藥物進行治療，常用的藥物有絨毛促性腺激素、促性腺激素釋放激素、睪酮等。如果藥物治療效果不佳的患者，可以通過手術(shù)治療，主要適用于勃起長度小于7厘米的患者。常用的手術(shù)方式為陰莖延長手術(shù)、陰莖假體植入術(shù)，但是具有一定的副作用，手術(shù)后可能會影響到正常的性生活。如果是肥胖導致陰莖短小，需要適當?shù)臏p肥。