正常人在咽喉部位存在一定的細菌，如果身體抵抗力降低或者咽喉部的機械屏障減弱時，這些細菌會進入肺內造成感染。存在上呼吸道的感染，是造成肺部存在細菌感染的常見原因。

肺部細菌感染大多數都是由于吸入所導致的。健康正常人群在口咽部都存在著一定數量的細菌，這些細菌也屬于條件致病菌，平時并不致病，當身體抵抗力下降時或者咽喉部的機械屏障減弱時，細菌就可以從咽喉部進入氣管以及支氣管在肺部繁殖，從而致病。也有一部分細菌是來自于空氣中或者其他有菌的環(huán)境，被人體吸入后在體內繁殖而致病。