1.非特異性慢性盆腔炎
多有分娩，流產(chǎn)，急性盆腔炎病史，月經(jīng)量一般較多，閉經(jīng)極少見;生殖器結(jié)核多為不孕，月經(jīng)量減少甚至閉經(jīng)，盆腔檢查時可觸及結(jié)節(jié)。
2.慢性輸卵管炎
臨床表現(xiàn)為月經(jīng)異常，下腹隱痛，腰骶酸痛，不孕等，應(yīng)與結(jié)核性輸卵管炎鑒別，慢性輸卵管炎多有分娩，流產(chǎn)后急性盆腔炎史，月經(jīng)量較多，而表現(xiàn)為閉經(jīng)者較為少見，沒有其他結(jié)核性輸卵管炎典型檢查所見，子宮內(nèi)膜活檢無結(jié)核病灶。
3.子宮內(nèi)膜異位癥
有繼發(fā)性，進行性痛經(jīng)，經(jīng)量較多，腹腔鏡檢查多能確診。
4.卵巢腫瘤
結(jié)核性炎性附件包塊表面不平，有結(jié)節(jié)感或乳頭狀突起，應(yīng)與卵巢癌相鑒別，可經(jīng)腹腔鏡檢查或剖腹探查確診。
5.輸卵管癌
輸卵管癌與輸卵管結(jié)核性腫塊在婦科檢查時很難區(qū)別，若有陰道排黃色或血性液體且數(shù)量較多時，應(yīng)考慮輸卵管癌，剖腹探查時將標(biāo)本送病理檢查可明確診斷。
6.輸卵管妊娠
臨床上表現(xiàn)為停經(jīng)，腹痛等易與輸卵管結(jié)核相混淆，一旦輸卵管妊娠破裂或流產(chǎn)時，即有內(nèi)出血癥狀，做血及尿妊娠試驗，B型超聲檢查，診斷性刮宮有助于明確診斷。